O manganês é usado principalmente como desinfetante, oxidante farmacêutico, catalisador, etc. na área médica.
Por exemplo, o permanganato de potássio é um dos desinfetantes mais utilizados na medicina porque é um oxidante muito forte. Uma solução de permanganato de potássio de 0,1%+ pode desempenhar um papel na desinfecção e esterilização. Além de ser utilizado como oxidante intermediário no processo de produção do sedativo fenal, o manganês também é utilizado como catalisador para a produção do analgésico antitérmico fenacetina.
O manganês também pode ser usado na área médica para preparar certos medicamentos e formulações de medicamentos, como alguns medicamentos para o tratamento da deficiência de manganês. Além disso, o manganês também pode desempenhar um papel catalítico na indústria de extratos vegetais.
Muitas empresas farmacêuticas adicionam produtos químicos com baixo teor de manganês em seu processo de produção: